目前我国商业保理通常有两种运行模式， 一种是由卖方发起的保理，其目的是对资金来源加以掌控。而这种保理模式控制流程与银行保理一定相似性，尽管保理商会对卖方信息进行核定，但却不能充分确保每个买方均有支付意愿及能力，据此，为消除个别买方存在的不确定性，保理商就必须从其他买方回款中来确保账款自偿性，以平衡或抵消个别买方的损失。 第二种模式则是由买方发起的保理，这种保理模式在银行十分常见，很多银行称之为“反向保理”，这种模式比较容易控制银行款的风险，不仅满足了中小企业短期资金的需求，增强了中小企业的生产稳定性和品质保证，而且有利于整个供应链的持续运作和价格竞争力。
商业保理公司注册要求：
（一）以公司形式设立，为实收货币资本，注册资本不低于人民币5000万；首期首次出资不低于20%，剩余部分两年内缴足；
（二）至少拥有一个投资者或其关联实体具有经营商业保理业务或者相关行业的经历；关联实体，是指该投资者控制的某一实体、或控制该投资者的某一实体、或与该投资者共同受控于某一实体的另一实体。控制是指控制方拥有被控制方超过50%的表决权。
（三）商业保理企业的投资者应具备开展保理业务相应的资产规模和资金实力，有健全的公司治理结构和完善的风险内控制度，近期没有违规处罚记录。
（四）商业保理企业在申请设立时，应当拥有两名以上具有三年以上金融领域管理经验且无不良信用记录的高级管理人员。高级管理人员，是指总经理（副总经理）、业务主管、财务主管、风险控制主管以及运营主管等。
（五）商业保理企业不得混业经营。
（六）有健全的内部控制制度，包括但不限于财务制度、风险评估、重大风险事件应急制度、业务流程操作要求、监控等制度及资产分类管理、风险处置措施。
（七）投资者设立存续满一年（符合条件的公司以其全资拥有的名义投资设立商业保理公司，可不要求存续满一年）。投资者具备开展商业保理业务相应的资产规模和资金实力，其资产总和不得低于人民币5000万元且两年内在税务、工商等政府部门和金融机构没有违法违规和不良记录。
（八）商业保理企业境内投资者注册资本已缴足到位，境外投资者符合其他法律法规相关要求。投资者如实披露实际投资人的背景信息及资产情况。
保理业务一般是以卖方为核心服务对象的业务，因此，选择适合保理业务的卖方是至关重要的。对卖方的考察主要从两个方面入手：
一是从企业本身入手进行考察，包括对企业财务报表的考察分析；对企业销售分户帐的分析；与企业管理层的面谈等。
二是从企业外部进行考察，包括从卖方主要往来银行获得相关信息及其对卖方的评价；从专业机构了解卖方所属行业的基本情况；以及通过对卖方客户（买方）的考察印证买卖双方所建立的业务关系等。
保理公司的监管方面，内资保理公司由工商管理局直接核发执照。外资保理公司由商委部门先进行前置审批（外商投资备案）、再由工商部门审批营业执照。内外资保理公司虽然经营范围的表述不尽相同，但其实际经营项目是一致的。