冬虫夏草的生长过程受自然环境影响很大。
海拔、气温、降水、光照时间、地理条件、寄主物种等因素决定了不同地方出产的冬虫夏草，在样子、外观特征以及内在品质、药用价值方面会有所不同。
因此，不同产地的冬虫夏草差异是比较大的。
冬虫夏草主要分为四川、青海、西藏虫草：其中青海、西藏产虫草质量上乘，虫体肥壮、饱满，表面色泽金黄色，子座较短；四川产虫草虫体较为瘦小，表面颜色较暗呈黄棕色，子座较长，质量次之。
回收冬虫夏草应彻底晒干后再保存
冬虫夏草彻底晒干后再保存相当于冬虫夏草干，冬虫夏草保存前也应彻底晒干，保证干燥如果发现冬虫夏草已经受潮，应立即取出暴晒，或用炭火微微烘焙成冬虫夏草干，再筛去害虫与蛀屑。保存的时候，如果量很少，而且储藏时间不长，只需将其与花椒或牡丹皮一起放在密闭的玻璃瓶中，置于冰箱中冷藏即可如果量大或者需要存放较长时间，在储藏虫草的地方加放一些干燥剂。但是，总的来说，虫草的保存时间不宜过久，否则会降低药效，还会虫蛀现象，甚至长毛，发霉，所以说冬虫夏草不易长时间保存，大量的话应该选择回收冬虫夏草商家进行出售。
虫草穿签（有作假和行业默许的区别）
①穿签草的来源：藏民采挖虫草过程中挖断和虫草用刷子去土的过程中会有少部分被刷断后，为了在与批发商的交易中卖个好价钱，就会用竹签或者草签串起来。
②行业默许的穿签方式：因为穿签草无法避免，需要交易的过程中仔细挑选。一是买卖双方把穿签草单独挑出来，去掉竹签后单独交易断草；二是在交易过程中，根据穿签草占的比例，根据经验评估价值，折价销售。
③作假的虫草穿签方式：一是用铁丝代替竹签、草签增加重量，二是在大量虫草中人工掺入更多的穿签草。
④针对客户的说明：由于穿签草可以人为挑选出来，所以虫草穿竹签、草签在虫草交易中可以尽量避免，但由于一些穿签比较隐蔽，人工难免遗漏，所以无法消除；铁丝草主要来源在源头，之前对虫草商也产生了不利影响，所以正规虫草商加强了对铁丝穿签的防范，目前大型虫草商在源头采购虫草的时候都会用X光机（金属探测）检验虫草。加铁丝这种方法目前存在于一些小商贩手中，在大型市场虫草交易过程都已经通过检测杜绝。
虫+草粘合法
①制假手法：将蚕蛹（或其他生物）制作成虫体样子，染色和加香后，再用胶水粘上草（蕨菜根），看上去有虫有草，很具有迷惑性。
②针对客户的说明：这类作假手法只能迷惑没有见过真虫草的人群，只要见过真虫草，从感官上就能辨别。目前，类似的作假在低端消费群体集中的地方较多。