珍珠奶茶一般使用较大颗粒的粉圆，烹煮后的直径约在7毫米以上，否则直径太小时很容易满嘴珍珠，也不方便吞咽咀嚼。但大多数的珍珠奶茶商家仍有提供小颗粉圆的珍珠。当然也有一种“琥珀珍珠”这种珍珠是用的红糖来做的。

珍珠奶茶使用的“珍珠”，是由地瓜粉(南方说法，即淀粉)制作而成的粉圆，而粉圆在加入奶茶之前，通常还会先浸泡糖浆，确保粉圆在偏甜的奶茶中，仍可以保持甜味。奶茶的基底通常使用红茶，但也有店家提供使用绿茶的珍珠奶茶(称为珍珠绿奶或珍珠奶绿)。也有许多店家以咖啡冻、豆花、布丁、仙草、等类似口感的食物添加进奶茶里，让客人自由选择以增加口感。

至于“珍珠”，一般使用较大颗粒的粉圆，烹煮后的直径约7mm以上，否则粉圆太小，用一般口径大的茶饮吸管时容易变得“满嘴珍珠”，也不方便品尝圆润香Q的咬劲。有一阵，南台湾的泡沫红茶店将使用大颗粒粉圆的珍珠奶茶称为“波霸奶茶”，而用小颗粉圆的称为“珍珠奶茶”。但在北台湾，珍奶店通常只卖“珍珠奶茶”，都使用大颗粉圆，后来变成了全岛统一的通称和规格。

点子：会Q的小粒方块状咖啡冻。

布丁：有以加入市售（或自制）的固体状布丁，也有些店面是以布丁粉作为调味，以奶茶常加入布丁。

仙草（广东人称作凉粉）：有些原先于冬日卖烧仙草的店家，于夏日时转型后的产物，后来被多数店家随后跟进使用。