其分子结构中的硅醇基与硅酸盐材料中的硅醇基反应脱水交联，形成优异的憎水层，同时具有微膨胀、增加密实度功能。这就是有机硅防水剂具有防水作用的机理。三甲基硅醇钠分子式：熔化前发生升华或分解的固体，生成三甲基硅醇的缩合物六甲基二硅氧烷。与含硅mgc键的化合物反应，特别是不对称的和支链的硅氧烷。

甲基硅酸钠易被弱酸分解，当遇到空气中的水和二氧化碳时便分解成甲基硅酸，并很快聚合生成具有防水性能的聚甲基硅醚，因而可在基材表面形成一层极簿的可以透气的聚硅氧烷膜而具有防水性，生成的碳酸钠则被水冲掉。

甲基硅酸的用途：广泛用于石材、木材、纸张、混凝土、珍珠岩保温板、防水涂料等领域，使其具备防水、不受风化或减少风化作用。用于与其它助剂混合作为防水保温材料填充剂,堵漏剂；直接作为防水材料使用，如公路的滞水粉、钻井的固井剂等。

可作为建筑材料如砖瓦或建筑物表面的防水、抗冻剂，用经铝或中和后稀释的甲基硅酸钠溶液处理木材、纤维板、纸张等可起到疏水、防腐和提高强度的作用。还可用作混凝土、沙浆、灰浆和水性漆、发泡石棉等的添加剂，或用以处理乙烯醇纤维和玻璃纤维等。