程序：1、申请人填写《保函申请书》并提交有关资料；
2、银行对申请人的资格、申请手续和项目可行性进行审查；
3、签定协议，落实保证金或反担保；
4、银行为申请人开立投标保函。
* 投标保函办理的金额一般为投标报价的1%—5%。
* 投标保函的期限
投标保函有效期一般为六个月以内，从开出之日起生效。
招标文件《投标须知》部分会有规定投标保函出具单位和单位要求，通常情况下是：（A）银行出具的投标保函，（B） 或者担保公司自己出具的保函。
（A）银行出具的投标保函。
客户去银行办理投标保函，如果50万的投标保证金，需要全额存入50万保证金至银行账户，还需要各种资料，办下来需要1周左右。因此可以借用担保公司在银行已有的额度开立保函，开具保函的单位依旧为银行。
（B） 担保公司自己出具的保函。
保函的落款为担保公司，此类保函也叫做公司保函，或者商业保函。
投标保函的有效期与投标有效期是不同的，一般情况下银行投标保函与后者是不会一致的，而且往往会比后者长，具体是多长时间就要根据工程项目的性质和招标文件的要求来确定，通常为30到180天，如果银行投标保函的有效期比后者短的话，那么银行投标保函是没有效力的。
也就是说银行保函的有效期是要覆盖投标有效期的。深层次的分析就是，投标保函多出投标有效期的那段时间，是给投标方时间来办理履约保函的，那么在这段时间内，银行投标保函的作用其实是暂时代替履约保函的履约担保功能。通常招标文件的规定时：担保方在确认此保函在招标通告中要求的投标截止日期或在此日期后的30天内仍然是有效地，延长投标有效期并不需要通知担保方。许多企业在投标时，办理的投标保函对投标保函有效期重视不足，经常把投标保函的有效期与投标文件的有效期混淆，觉得保函有效期少了30天的现象。
有些企业也经常会遇到投标保函格式的问题，就是如果甲方有自己的格式，但银行为了保障自己的利益会不接受某些条款，会对格式进行修改，此时作为乙方就要跟甲方沟通了，如果甲方坚持不能修改，企业拿银行修改过的投标保函格式去投标，会导致废标，给双方都会造成损失。
推行工程保函替代保证金。对于投标保证金、履约保证金、工程质量保证金、农民工工资保证金，建筑业企业可以保函的方式缴纳。同时强调现金保证金：严禁将现金保证金挪作他用，保证金到期应当及时退还。农民工工资支付担保是“见索即付"的独立保函。支持多个担保保证人开展业务，保证公平竞争！并公开企业资质、人员资格、工程业绩、信用信息以及工程担保相关信息。
主要内容如下：
投标担保：投标保函的金额不得超过招标项目估算价的2%，不超过80万元。
履约担保：依法必须招标的工程项目应当在招标文件中列明承包单位提供履约保函。民间投资的住宅工程应当实行履约保函。采用价中标的工程应当推行高保额履约保函，保函金额由建设单位在招标文件中确定。
工程款支付担保：对建设单位的诚信评价，将诚信评价结果作为实行工程款支付担保的重要依据，采取差别化的政策，以激励和强化对建设单位的行为规范。对发现工程款拖欠的工程依法予以停工。
强化工程质量保证担保应用：在住宅工程中推行工程质量保函，保函金额不得超过工程价款结算总额的3%，工程质量保函有效期应与施工合同中确定的工程缺陷责任期相一致。建设单位到期未退还保证金的，应作为不良行为记入信用记录。
农民工工资支付保函：在工程建设中推行农民工工资支付保函，并实行差别化管理，连续两年未发生拖欠农民工工资情形的施工企业不用提供农民工工资支付保函。对有拖欠农民工工资记录的施工企业，应纳入建筑市场主体"黑名单"，实施失信联合惩戒。