申报明细表与年度财务报表相关联，是指企业近三个会计年度研究开发费用结构明细表和近一年高新技术产品(服务)收入明细表的相关数据包含在已审计的年度财务报表中，两者适用的会计准则或会计制度是一致的，在相关会计政策、会计估计方面不存在差异。

不论企业以前年度财务报表是否委托注册会计师进行审计，还是专项审计与年度财务报表审计是否为同一家会计师事务所承接，专项审计都可以按照《专项审计指引》独立实施审计程序。如果结合以前年度财务报表审计，确定的重要性水平应当低于相应财务报表审计的重要性水平，确定审计范围时应当考虑拟利用以前年度财务报表审计工作中获取的审计证据的程度。需要注意的是，应当结合具体环境考虑重要性的性质和数量两方面的因素。

与高新技术产品(服务)收入相关的内部控制包含在企业产品或服务的销售控制中，而如高新技术产品(服务)收入与研究开发激励或与销售奖励相关联时，企业一般会设计或增加相应的控制环节。注册会计师审计时，需要了解申报企业能否确保销售均已准确记录并对高新技术产品(服务)进行恰当分类。

企业申请成为高新技术企业时，一般需要对高新技术企业进行专项审核，通过高新技术企业认证。企业开展此项审计活动，需要第三方审计机构出具高新技术企业专项审计报告。由于不同企业的业务做法不同，审计工作难度也存在一定差异。建议企业找专业的审计机构获取具体服务！