尽管有着众多的优势，但是木质包装材料的本质属性决定了他具有一定的生态环境风险，而这一点在应用之初，并未为人们所重视。近些年来以松材线虫为典型的一批有害生物逐渐进入人们的视野，而他们在全世界范围的传播就是借助于国际航运中所使用的木质包装材料。人们这才开始重视对包装材料的检疫工作，于是对木材采取熏蒸、热处理等方法进行除虫处理，以遏制有害生物疫情随着货物运输而在全球扩散。
包装结构设计是从包装和生产实际条件出发,依据科学原理对包装的外形构造及内部附件进行的设计.设计时必须保证结构有足够的强度、硬度及抵抗其他环境的能力.从包装的目的来看,必须考虑以下两个方面,一是保护产品的首要功能,二是满足现代包装的重要特征,如运输、加工特性等。
目前,我国只是对纸箱的箱型作了明确的规定,而对纸箱的尺寸大小却无具体要求,主要由设计者来定.而设计者在确定纸箱尺寸时又主要是考虑两方面的因素:一是能够包容得下内容物;二是具有足够的强度.其实,制约纸箱大小和形状的因素除去包装内容物外,还有许多其它的因素,如人机工程学方面的因素、托盘的尺寸、货车车厢的尺寸大小、集装箱空间的尺寸大小、配货架的尺寸大小等.这些因素间既相互独立,又相互制约影响;既要考虑包装功能,也要考虑方便性.所以设计时只有系统地、综合地把握住所有的制约因素,才能够真正合理地确定纸箱的尺寸大小。
木箱是以木质材料为主制成的有一定刚性的包装容器,也是产品运输包装的主要容器之一。可分为：普通木箱，框架木箱，滑木箱，胶合板箱，花格箱等几种。在我国，出口商品使用木箱包装非常普遍，尤其在轻工、机械等包装领域，更是起着不可替代的重要作用。