尽管有着众多的优势，但是木质包装材料的本质属性决定了他具有一定的生态环境风险，而这一点在应用之初，并未为人们所重视。近些年来以松材线虫为典型的一批有害生物逐渐进入人们的视野，而他们在全世界范围的传播就是借助于国际航运中所使用的木质包装材料。人们这才开始重视对包装材料的检疫工作，于是对木材采取熏蒸、热处理等方法进行除虫处理，以遏制有害生物疫情随着货物运输而在全球扩散。
木包装箱的回收复用是木包装箱回收、资源化利用的途径。这种回收复用可以是定点长期供货。定点地回收及出口地双边协议。定点长期供货适用于长期向另一地区或几个地区提供产品的厂家，定点地回收适用于货物流通量大，流通距离短的产品包装。对于包装出口产品，可以建立某种包装回收双边协议，使使用过的木包装箱能在跨国流通中回收利用。
除去包装内潮气保持干燥的方法有两种：即静态干燥法和动态干燥法。静态法是用装入包装内一定数量的干燥剂，吸去内部的水分来防止被包装产品受潮，其防潮能力决定于包装材料的透湿性、干燥剂的性质和数量、包装内容空间的大小等等。
总之,在包装箱的结构设计中,要根据使用的制造设备、不同的生产工艺、不同楞型构成的包装以及内装商品的种类和性质来确定.只有掌握了设计包装箱的结构、尺寸相关的内容后,才能制造出保护商品、美化商品的包装箱。