履约保函：是指担保人为施工方(申请人)向业主(受益人)提供的，保证施工方履行工程建设合同规定的相关责任和义务的保函。如果承包商不履行合同，业主可要求保证人在保函金额内承担保证责任。保证人在承担保证责任后，可依法向承包商追偿。担保公司提供的履约保函一般为有条件的保函，即在业主提出索赔时必须提供承包商违约的证明，保证人核实后才承担保证责任。履约保证担保也可以适用于分包合同、材料设备供货合同的履行
预付款保函：
是指担保人(保证人)根据申请人(合同中的施工方)的要求向受益人(合同中的发包人)开立的，保证一旦申请人未能履约，或者未能全部履约，将在收到受益人提出的索赔后向其返还该预付款的书面保证承诺
差额保函：
为防止投标人低价抢标，招标文件会设置一个风险控制价(一般为招标上限价的85%，亦有例外，具体看招标文件规定)，凡低于该风险控制价的，中标人在提交履约保证金的同时必须额外提交中标价与风险控制价之间的差额担保，可以用保证金的方式，亦可用保函的方式，用保函方式提交的，该保函即为差额保函(风险控制价-中标价=差额)。一般差额保函金额超过中标价的20%，风险较大，原则上不予办理。
预付款保函与履约保函的区别：
履约保函是为了保证中标单位如约履行工程合同的内容
预付款保函是保证在甲方支付了预付款之后能收到合同约定的效果，也即在甲方支付了预付款之后如乙方没有履行合同，银行则将预付款保函的相应押金交还给甲方作为损失补偿。
也就是说这是两个不同的保函，都是要交的。因此从某一个角度也能体现施工单位的经济实力。
不过不用担心，作为预付款的保函既然是为了保证预付款的，就不像履约保函那样一定要到工程全部建设结束，合同内容履行完毕之后才退还给你。通常是约定保证预付款用在合同上就可以退还了。只是在工程建设前期冻结在银行，后面就解冻了。