是指要求海关对其知识产权实施保护的权利人，将其知识产权的法律状况、有关货物的情况、知识产权合法使用情况和侵权货物进出口情况以书面形式通知海关总署，以便海关在对进出口货物的监管过程中主动对有关知识产权实施保护。根据2003年12月修订的《知识产权海关保护条例》，知识产权备案不再是海关对知识产权实施保护的前提，未进行知识产权备案的权利人仍然有权向口岸海关申请扣留进出口的侵权货物。但是，事先是否进行知识产权备案，在实践中有很大的差异。
录入备案申请数据
注册用户登录备案申请系统后，在申请新备案窗口内填写申请备案的知识产权和其他相关信息；
缴纳备案费
现已无需缴纳备案费。
提交纸面申请书
将已录入的备案申请数据打印成纸面申请书并加盖申请人或代理人印章，连同备案费缴款凭据复印件和其他相关材料邮递至海关总署的下列地址：
海关总署政策法规司知识产权保护处
北京市建国门内大街6号 邮编：100730
补正申请
海关总署在收到申请人邮递的纸面申请后才开始进行审核。但是申请人可以通过备案系统随时了解海关总署受理、审核、核准和驳回申请的全部过程。申请人可以根据海关总署驳回申请的意见，对其申请进行补正。
收到核准或者驳回申请的通知
根据《知识产权海关保护条例》的规定，海关总署应当在自收到申请人提交的全部申请文件之日起30个工作日内将做出核准或者驳回申请的决定。海关总署核准或者驳回备案申请，都应当向申请人发出书面通知。海关总署驳回申请的，不退还原申请文件。
在实际的工作当中大多选择上门申报的方式来进行税款的申报，纳税人或是扣缴人可以在纳税申报期间内到主管部门的办理大厅进行办理纳税申报工作。除了这种上门申报的工作以外，还可以采取邮寄的方式进行申报工作，纳税人在邮局办理相应的纳税申报工作，可以使用纳税的专用卖报信封，通过邮局的收据为凭证进行税款的申报依据，以寄出的时间以及实际申报的日期为基础进行上报。