王永钧长期从事肾脏病临床及研究，对中医经典和历代名家学术思想颇有研究。王永钧带领肾内科团队，创建了IgA肾病从虚、瘀、风湿辨治体系，提出IgA肾病五型辨证新方案 .王永钧将中西医融会贯通，总结出了慢性肾病临床演变规律。
截至2021年8月，王永钧已发表论文200余篇，主编、参编《肾脏病专家门诊》《中西医结合肾脏病学》《中医临床内科学》《中医临床肾脏病学》等学术专著9部。截至2021年8月，王永钧已领衔完成国家“十一五”科技支撑计划、国家科技部“八五”“十五”项目等多项重大课题。
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