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傅佩芬擅长乳腺良恶性疾病的影像学诊断；各类乳腺癌手术（乳腺癌根治术、结合整形修复的保乳手术、前哨淋巴结活检术、乳癌胸壁缺损修复术等）；乳腺癌同期乳腺再造手术；乳房肿块的微创旋切手术；各类乳腺整形手术（乳头内陷矫正、巨乳缩小、隐蔽切口的乳腺手术等）；化疗静脉输液港植入手术；乳腺癌个体化化疗，乳腺癌的内分泌，乳腺癌的靶向，乳腺癌的随访及全程管理.
傅佩芬主任医师乳腺癌的多学科、个体化综合诊治；乳腺癌术后乳房重建技术；乳腺癌发病机制、耐受机制、预后相关基因等方面基础及转化医学研究.带领团队每年完成乳腺癌综合1000例以上。发表SCI论文二十余篇，主持及主参省厅级课题6项，参编医学著作10部，负责临床多中心乳腺癌研究十余项。
傅佩芬任职中国临床肿瘤学会乳腺癌专家委员会常委；中国医药教育协会乳腺疾病专业委员会常委；中华医学会外科学分会乳腺外科学委员；中国协会乳腺癌专业委员会委员；中国医师协会乳腺外科医师委员会委员；中国医师协会乳腺癌专业委员会委员等。