化粪池的清掏周期与粪便污水温度、气温、建筑物性质及排水水质、水量有关。设计清掏周 期过短，则化粪池粪液浓度过高，与实际清掏周期差距过大，影响正常发酵和污水处理效果，甚至造成粪液漫溢，影响环境卫生。设计清掏周期过长，则化粪池容积过大，增加造价。
化粪池清理方法是先用吸粪车吸出表层液体，再用高压水冲洗，待气味发散一会儿后，才能下人清理淤积物，化粪池长期不清理，其中积存的沼气让化粪池变成了一个隐形“炸弹”。
机械清理是一种更加快捷的化粪池清理方式，相较于人工清理能够更加彻底地清理化粪池内的杂质和污垢。通过专业化粪车清理，清洗效果十分明显。不过，机械清理需要使用重型设备，而且操作难度较高，需要有一定的经验和专业技能。
长期不清理化粪池的危害：
化粪池是处理粪便并加以过滤沉淀的设备。其原理是固化物在池底分解，上层的水化物体，进入管道流走，防止了管道堵塞。化粪池长期不清理，首先就是分解之后产生的大量气体，其中有易燃易爆的甲烷和其他有毒、有异味的气体影响居住环境，还有隐患。而且异味问题会很头疼，谁都不愿意生活在满是秽物异味的环境里。
化粪池太久不清理会漏出来，化粪池长期不清理池底积累过量污物，有可能会渗到地底，污染地下水源，给周围的水系环境带来严重的破坏。也会漏出地面，影响生活起居和工厂作业。所以说要定期清理化粪池。