主要研究方向为儿童糖尿病领域，涵盖儿童糖尿病流行病学研究、生存、代谢控制状况及胰岛素抵抗相关疾病范化研究。先天性高胰岛素性/新生儿糖尿病临床与遗传学研究。性腺研究主要包括婴幼儿乳房发育临床监测、DSD病因学及Kallmann综合征的基因学研究、小阴茎的、AAA综合征的遗传学研究、DSD患者体格发育研究、Silver Russule 综合征遗传学研究等。同时承担研究生教学以及留学生英文教学。
巩纯秀，首都医科大学附属北京儿童医院，内分泌遗传代谢科，主任医师，博士，教授，博导。临床擅长糖脂代谢疾病（儿童1型糖尿病、2型糖尿病、肥胖、低血糖、高血压、特殊类型糖尿病）生长及骨代谢（身材矮小、佝偻病、甲状旁腺疾病、发育迟缓）性腺及肾上腺疾病（性早熟、DSD（性发育异常）等。
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