北中医三院目前编制床位520张，有34个临床科室，5个医技科室，4个门诊部，3个社区卫生服务站;医院有正高职称专家62名，副高职称专家113名，具有博士学位人员161名，硕士学位人员204名。医院有北京中医药大学经方现代临床应用研究所、北京中医药大学骨伤科研究所。
北京中医药大学第三附属医院针灸微创肿瘤科黄金昶医生代挂号预约。
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预约挂号，挂专家号更是“一号难求”,这是当前许多大型医院的普遍现象。预约挂号是各地近年来开展的一项便民就医服务，旨在缩短看病流程，节约患者时间。这种预约挂号大多通过医疗机构提供的电话或者网络进行，基本上是免费或者只收取很少的手续费。由于预约挂号需要事先登记患者的信息，并且可以减少在医院挂号窗口排队等待之苦，因此它一定程度上也有利于改善就医环境，促进“实名制”的推行，受到了不少患者的肯定和欢迎。 2016年初开始，北京市在其市属医院推行预约挂号制度，该制度正在进行普及。
规范专家出诊 《意见》要求，医务人员要按既定的时间出诊，特殊情况下需要变动的，要提前公告，取得患者的理解，并进行妥善安排。要按照医院工作制度要求，规范医务人员特别是专家出诊、会诊、休假等的管理。《 意见》要求，出诊安排一经确定在一周时间内原则上不得无故变动。 此外，《意见》还要求二级医院也要逐步开展上述工作。