三格式化粪池是由三个相互连通的密封粪池组成，粪便由进粪管进入池依此顺流至第三池，其各池的主要原理：
池
主要截留含虫卵较多的粪便，粪便经发酵分解，松散的粪块因发酵膨胀而浮升，比重大的下沉，因而形成上浮的粪皮、中层的粪液和下沉的粪渣。利用寄生虫的比重大于粪尿混合液的原理使其自然沉降于化粪池底部。利用粪液的浸泡和翻动化解粪块使其液化并截留粪渣于池底。厌氧发酵：化粪池的密闭厌氧环境，可以分解蛋白性有机物，并产生氨等物质，这些物质具有杀灭寄生虫卵及病菌的作用。
第二池
起进一步发酵、沉淀作用，与池相比，第二池的粪皮和粪渣的数量减少，因此发酵分解的程度较低，由于没有新粪便的进入，粪液处于比较静止状态，这有利于漂浮在粪池中的虫卵继续下沉。
第三池
主要起储存粪液的作用。经前二格处理的粪液进入第三池，基本上已经不含寄生虫卵和病原微生物，达到了粪便无害化要求，可以供农田直接施肥。
清理化粪池注意事项：1、进化粪池的人得带好防毒面具和防毒服，还有得带好带，带上要捆上一根能够承重100公斤以上的绳子，绳子的另一头捆在露在化粪池外的梯子上。
2、化粪池上面得有两到三个人随时注意化粪池里面的情况，要是下面情况不对的地方就把清掏化粪池的工作人员给拉上来。
3、化粪池一般有三个井盖，每个井盖上都有两个小洞，我们得把每个井盖上的小洞打开后在隔半个小时或者一个小时。
4、再用铁钩把井盖打开，打开后在用消防水往每个井口里冲洗半个小时左右。这样能使化粪池里的沼气减少很多。
5、再用一根长度为5米左右的竹竿往化粪池里插，得到化粪池里的污物和污水的深度。
6、若是化粪池里的深度超过1.5米，我们就得用比化粪池还深1米左右的竹梯或者其它梯子放到化粪池里。
清理化粪池作业前工作准备：1、制订合理的工作安排和合理的工期。
2、检查防护工具，检查设备，检查车辆工作能力，水电是否可供应。
3、将准备施工的化粪池提前2-4小时打开用轴流风机进行通风，并且在周围做好防护警戒线和专人看守（防止行人车辆掉入池里造成事故）。
化粪池清理程序：
钩打开化粪池的盖板敞开15分钟，把吸粪车开到工作现场，套好吸粪管放入化粪池内，再用铁铲搅动化粪池内粪便结块层，一边放水一边搅动，启动吸粪车开关，吸出粪便直至化粪池内的结块物吸完为止，盖回化粪池盖板，用清水冲洗净工作现场。