北京大学肿瘤医院胃肠肿瘤中心二病区拥有的胃肠肿瘤诊疗和研究团队，比肩国际胃肠诊疗中心。共开放床位29张，专长于进展期胃肠肿瘤的手术和综合、早期胃癌的保留功能手术、低位直肠保肛手术等。主治病种包括胃癌、结直肠癌、胃肠道间质瘤和其他少见胃肠道肿瘤。在多学科讨论的基础上，为每一位患者制定和实施为合理的诊疗规划。在中心主任季加孚院长的直接领导下，科室秉承北京大学肿瘤医院的优良传统，追求，不断进步，在临床、科研、教学等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持稳健、严谨工作作风的同时，走上了高速发展的快车道。科室人员结构：1、人员构成：主任医师3人，副主任医师6人，主治医师7人，住院医师2人，护理人员17人。2. 科室主要领导：胃肠肿瘤中心主任季加孚，科主任步召德，护士长赵旻。
科室特色包括：微创手术、外科、疑难手术、功能保留手术、快速康复、病人全程管理。
家族遗传性肿瘤中心旨在为家族遗传性乳腺癌患者和高风险人群提供遗传咨询，易感基因检测和结果解读, 风险评估和家系管理，以及的个体化。为携带BRCA1/2突变的高风险健康女性提供乳腺癌发病风险评估和早期诊断，以及可能的预防性干预措施，包括双侧乳腺预防切除及I期重建。为携带突变的乳腺癌患者提供适宜的手术方式，在充分评估对侧乳房发病风险的前提下，为其提供对侧乳腺预防切除和I期重建， 以及针对性的辅助化疗和潜在的靶向，使家族遗传性乳腺癌患者获得的效果。学科带头人解云涛教授长期致力于家族遗传性乳腺癌的研究和临床诊治。率先在国内开展乳腺癌易感基因BRCA1/2的临床检测及临床实践，领导的团队完成了国内宗的乳腺癌易感基因检测， 在家族遗传性乳腺癌的诊治方面积累了丰富经验。本中心将秉承“患者利益，努力方向”的宗旨，竭诚为家族遗传性乳腺癌患者提供优质的专业化临床服务。
本中心开展下列特色医疗服务：
1. 遗传咨询
2. 乳腺癌易感基因BRCA1/2的检测及结果的专业解读
3. 高风险个体乳腺癌发病风险的评估及预防干预建议
4. BRCA1/2突变健康女性的乳腺预防切除及I期重建
5. BRCA1/2突变高风险家系的健康管理及优生优育
北京大学肿瘤医院介入科创建于1996年，是一个独立的、有鲜明特色的临床科室。目前介入病房有34张床位，医师13人，其中正高职称医生2人，副高职称5人，中级职称4人，住院医师3人，在读研究生4人。科室配备了GE大平板血管造影系统(4100IQ)，具有大视野DSA功能、三维血管成像和CBCT成像功能，三维血管容积成像使经血管的肿瘤介入准确性和性明显提高，同时完成的CT断层重建使经皮穿刺介入功能进一步完善。目前正在安装配置国际Siemens Miyabi Angio-CT系统，该系统具有滑动64层螺旋CT功能和大平板数字化减影功能，并实现CT和DSA的真正融合，是现代影像学引导介入的典范，推动该科的介入达到国际先进水平。
我院手术室是为患者提供手术的外科临床平台科室，是北京大学肿瘤医院打造国际化肿瘤专科医院的重要战略支撑。现有24个手术间，每年开展2万余台各类恶性肿瘤手术，包括胃癌、肺癌、乳腺癌、结直肠癌、食管癌、肝癌、腹膜后肿瘤、卵巢癌、胰腺癌、宫颈癌、前列腺癌、膀胱癌、肾癌、骨与软组织肿瘤、头颈肿瘤等各种常见及罕见的恶性肿瘤。依托于手术室先进设备及手术室护理团队多年经验，手术室护理团队可熟练配合各项肿瘤常规及复杂手术。团队在2D、3D、荧光腔镜、超声刀、Ligasure、ERBE等操作上具有丰富的临床经验;在术中超声设备、自体血回输设备、腹腔热灌注化疗设备、术中放疗、胸科磁导航设备、人工心肺机等配合使用上也富有经验。