银行承兑汇票属于我国《票据法》规定的票据，国内信用证是《国内信用证结算办法》明确的结算方式，两者的格式都由人民银行统一规定，但具体内容大不相同。银行承兑汇票上的必须记载事项有“表明银行承兑汇票的字样”、无条件支付的委托、确定的金额、付款人名称、收款人名称、出票日期、出票人签章；而信用证上的要素相对较多，除了相应的当事人名称、账号、金额等要素外，还有对货物的详细描述，以及对卖方提供单据的具体要求等。
国内信用证体现的是单款对流的方式，银行承兑汇票体现的是货款对流的方式。在国内信用证项下的商品交易，卖方是凭单交货，买方是凭单付款。卖方向承运人提供货物后获得运输单据(凭单交货)，再将全套单据(包括代表物权的单据如货物提单、商业发票等)交给银行，由银行办理托收(或向银行办理议付)，买方向通知行付款赎单(凭单付款)。而银行承兑汇票项下的商品交易通常采用的是一手交钱，一手交货的方式即买方向卖方交付票据(通过背书方式)，卖方验票后交货。
国内信用证可以根据买方，或者卖方的要求进行修改，往往是贸易双方对合同上的条款进行了修改，相应地对信用证上的条款也进行修改，甚至修改信用证金额，这就给交易双方带来了方便。而银行承兑汇票上的金额不能进行修改，也不能对部分金额进行背书转让，只能以此金额终办理结算。这也是一些客户将大额银行承兑汇票质押给银行，重新签开若干小额承兑汇票用于不同用途支付的主要原因。
通过对银行承兑汇票和国内信用证的比较可以看出，银行承兑汇票和国内信用证两者都是支付结算工具，都有短期融资功能，又各有特点。银行承兑汇票从转让流通、终付款方面显得比较灵活，而国内信用证将买卖双方合同中的彼此约束和货款支付紧密联系在一起，可以有效避免双方收款不发货、收货不付款的现象，从而保证合同的履行。