北大六院建立了以院士、长江学者、国家杰出青年基金获得者、“973”计划首席科学家、教育部新世纪人才、国家青年科学基金获得者、博士研究生导师等为学术带头人、中青年科研人员为骨干的临床及基础研究队伍，形成了以心身医学、生物精神病学、社会精神病学、儿童精神病学、临床精神病学、精神药理学六个领域为方向的科研团队。历年来我院承担多项国 家级、省部级和国际合作项目，并获多项重大科研奖励。
2014年10月23日，北京大学第六医院被科技部、国家卫健委和总后勤部卫生部正式认定为国家精神心理疾病临床医学研究中心。由北京大学第六医院牵头并联合北京大学心理与认知科学学院、中国依赖性研究所等共建单位共同组建的国家精神心理疾病临床医学研究中心，旨在针对临床研究瓶颈问题，开拓临床研究创新体系，建立以多目标、多任务研究方案为基础的新型临床研究模式;构建规范化、高质量的协同研究网络和多中心研究平台，开展多中心、大规模、高质量的精神心理疾病临床研究，提高全国精神心理疾病预防、诊断、治 疗和康复的综合服务水平，切实解决临床关键问题。
北京大学第六医院精神科的刘琦教授透露，根据国内的数十项研究估计，每1000个中国人中，有16个人患有重性抑郁障碍。在一年里，每1000个中国人中，会有23人患此病。值得特别关注的是，农村人口患有重性抑郁障碍的可能性（2.0％）高于城市人口（1.7％） ，女性患有重性抑郁障碍的可能性（2.3％）高于男性（1.4％）。
从实习医生到主任医师，刘琦医生已经在北大六院工作了二十多年。每日查房看患者、调整方案、日常带教、出门诊以及作为科室副主任承担一些科室管理工作，她的工作十年如一日。病房的住院医三个月或六个月轮转一次，经她带教的住院医也有几百个了，几乎没有住院医不喜欢她。