令狐恩强率先定名完善消化内镜隧道技术，模糊了消化内外科的界限，替代了一批传统外科手术；率先提出基于保持人体解剖结构不变条件下，达到祛除疾病目的的超级微创手术新概念，替代长期存在以切除器官为代价的手术模式，为未来手术方法学与器械研发指明了方向。
令狐恩强为中国逆行胰胆管造影（ERCP）规范的出台做出了积极的贡献，为中国消化道早癌的内镜下技术的完善与普及做了大量工作，为中国的内镜下早癌切除跻身世界先进行列做出了积极的贡献。
令狐恩强是一位患者可以生死相托的临床好医生，他的爱心里有着对患者感同身受的体贴，似乎有着当一名临床好医生的先天条件，他也是一位临床研究成果颇丰的医生。
与外科手术比较，消化内镜技术便是一种超级微创医疗技术。随着临床医学与迅速发展的光机电信息科学、材料科学以及生物工程科学等领域高新技术的有机结合，有越来越多的手术在内镜下完成，进而成为消化道疾病的常规方法。